mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGGATGAAGAATCATTAA GATGGTATTTGATTCTTACCC CGGAAGGTTAATTAGATGATGGTATTTGATTCTTACCCAATGGCTTGTAATGTAATTAATCAATGGATAATTATATGCGTACTATGAACTTTGAGGATGAAGAATCATTAATGGAAAACTTTTCGAGTAC CGTCAGGTGATCAATTTTCATAACGGCAAGGAAAGTTGTGTGAGTGCGCCACACCATATTTTTGCTTTAACATTGGCGTATGAAGGGGGCTCCTTTTTCCTTTTAATATTGTCATTGAAAGGCAAAATTTCCAAGAACCTTGTATATCCGTCGACGCGCGATTGGAAGGGGAACATACCTGTCAAATTTCGTGAAGGTCTGTTGCCGCGTTTCGCCGTAAATGCGCAACATATAAACATATAACAAGAATACTTGCTATTTTCTATAATCGATCGATTCAAGTATCCCTATTAAAATACTTTGTTGAAAAGATGCATTGATTTTTAATTTTTATTGTAGCACGATAGTTCCATTTGTAATTGGGTGAATATGTATGATTGTGGGTATACGTGTAGATTATTTATTGATTTGCTTGTATGTTAGTAAACAAAACAATAACAATGGGTTTGTATAGTTTGTATTGAAAGTATGATCTCTGGTGTGGTATTATTGGTGACCTTCCGGCAGTCGCGCTGTTGTAAAAACTACGTAACACTTGGAAAATTGGATGTTGTACAAAATACAACACGCGACTGCTCGTGTGATTGAGTAGGGCGCGACTACCGGAAGGTTAATTAGATGATGGTATTTGATTCTTACCCAATGGCTTGTAATGTAATTAATCAATGGATAATTATATGCGTACTATGAACTTTGAGGATGAAGAATCATTAATGGAAAACTTTTCGAGTACAAAAATTGATGAAGAAATATTTCTTTGTATATAGATCATACATAGGCCTATACAGCAAGAAGCTAGTCTATGCTCGGTTGCACAGCCTTAATGGAATAGCTTTCGAGTACAAAAATTGTATGAA 4 0 3' arm Nilaparvata_lugens mirnest 100 100 -25.6 (((((((((..(((..(((((((.(((.(((((((....((((..((((.((((((((.((....))))))))))))))..))))......))))))).))).))))))).)))..)))))))))..... (-25.6)