mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAATTCGGTTCTAGAGAGGT CCTGTAGATCCGAATTTGTT TTTACATCTACCCTGTAGATCCGAATTTGTTTGACATAAGGCGACAAATTCGGTTCTAGAGAGGTTTGTGTGG GCTTATCAGGGCTGCTTTGTGCTCTCTATATCCTCCCAGCTTCCACAGTCTTTCTCTCTTTTTCAACCATCAAATGTAATCACGATACAGAAGTGATGAGGTAGAGGAGAAAACGAATGTTGTGGAGGAATGCAGGAGGAGAAGGCTCATCAATTATCAAAGCTTCACTCACTCCACTGGATTTGCATTTTAATAACCAATTGCAGTAAGAACATTTGCACCATGAGCTGCCTTCTTCTCTTCAAGGTTAATGCTTTACATCTACCCTGTAGATCCGAATTTGTTTGACATAAGGCGACAAATTCGGTTCTAGAGAGGTTTGTGTGGTGCATATACAATACGACTAATCAACCATCAACCTCTACCAACTACTACCGTTACCGCTACATCAATTGAAGATCCTCCTCCATTATTCTAGAATATAATCTACTATAGTTTGTGAGTAGAATTAATAGTGTAAGATACTTAAATTAATTATTTATACGAAACTGTATTATTTGAGTAAAATTAGATTACTTGAATTGATTGATAAATATCAATCTAATCATCAAGGTCTAGTTTCAAATTCATCATCTTTTCAGTACGGTACCTGTTCAACTGGATATGACCCTCGCATAGTTATAAGG 2 1 3' arm Nilaparvata_lugens mirnest mir-10 3e-28 tca-mir-10 3e-28 -25.5 ..(((((..(((((.((((.(((((((((((...........))))))))))).)))).)).)))..))))). (-25.5)