mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATACAACTTACTGTCTTTC TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT GTTAAAGACTGTCCTTTGGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCATACCCTTCCTGTCAGATAACTATACAACTTACTGTCTTTCCTGAAGTGGCTGTAATGT GAGCAGTAAAGCTTAAGAACAGTGTTTCCAATCCTTTTGGCGTGTGACCCCTTTAAATCTAAGTATTTGCTAATCGCAACCCCAAGCCACAGGTTGCACGTGAGATGTATAAATTGCAAGCAGTTCAACCAAAGAGGGATTTTTCAATCACAGATAATTTATAATAAAAAATGTTTTTGATAAGATCTGAAGAGGATAAAACTTTATATTACTTTGCATGTTTTCAATGTCACAGTACCCTCCAAGTTATTTGCTGGGCTCATTTGAATATGGAAATATCCCACCCATACAATTTGTTTGGATCATATGCACCTTGTTGCATAATTTGAATCCCCTTAAGCTGCAGGCCTGAACCGGATGACCCGGTCGTCACACTGTGTTCTGAACACACTGACTGCATTCACAGCGGTGAGGAGAGGCCATGAGTGTTTGTGTTTCAGTGAATCATAACCGCTGTTTTGCATTCATCGAGGTGTGGCCAAGCGGACTACCTGCATGAGCGGGGACCTGACATGACTTTGTTGTTAAAGACTGTCCTTTGGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCATACCCTTCCTGTCAGATAACTATACAACTTACTGTCTTTCCTGAAGTGGCTGTAATGTCATCAGATGCCATTGTTGGAGCCTTTGAACCTGGATCCACCCTGGTATGAGCATGTGTACCCGCTGACTGCTGAACACAGATTTCCAATGCAG 1 0 3' arm Dissostichus_mawsoni mirnest let-7 1e-31 tni-let-7a-2 5e-40 -37.5 .......((.((((((((((..(((((((((((((((((((((..(((((...)))))...........))))))))))))))))))))).))))))).))).))..... (-37.5)