mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGGGGGTGGGAGGAGGTTA GCTACCAATTATGCTTCACAGA GCTGTTAATTTTGTGGGGGTGGGAGGAGGTTAAAGTTTGTCCAGGTACATTTGTCTATGCATGTAGTAATGTAAGCCTTTTTAACTTAACATTTCAGTTTTGAATGCCGCTTGCAATGTTTTGGGCACACACAGCTACCAATTATGCTTCACAGAATCAAATA GGGGGTAGGGGTTTGGGGGGAAAGGAGATGGAAGTTGATTTATGGTCATTTGAACCAACAACAGTAGTCTTTGTGGTTAGTTCAGGATTTTTATATAAGATATAGACACGCTGATGGCACAAATGGGAACTAAAAGACGAGAATTCATTCAGATTTGTTTTTACATTGAGAGACTTGAGAGTTGGTAAGTGTTTATAACACTGGTACCTTTTTTATTTAGCAGTTTAGTATTCATGACCACAATGTTATATGTTTGCACAGGAGATGGACTGGTAGGTAGAAGTAGGTTGACACTAAAGTGCTGTTAATTTTGTGGGGGTGGGAGGAGGTTAAAGTTTGTCCAGGTACATTTGTCTATGCATGTAGTAATGTAAGCCTTTTTAACTTAACATTTCAGTTTTGAATGCCGCTTGCAATGTTTTGGGCACACACAGCTACCAATTATGCTTCACAGAATCAAATACATTTTAAAGAAATGCATATGAAAACTGAAATCCTTACTAGGTGGTGCCAATGTCCAAATTAATTATCTGGAATACTCACATTCTTGGTACAAAGCAGTCCTTGATGTTAGTGGTCTTTACTAAATGTTTGTACTTAAGGGCTGAAAAGAATGACTCTTTGTCTGAAATGTAATCCTCACCAGGCTTTCTTATGTTAAATATATAAGATGGCTTGGTGACACCTTGCCTTTCATTATGAATCTGTATTTAATTTGCACCCTGTAATCCACCAGTAATGTATTTTGTATTGAAATAAATGCCAAAGACTTTTTGTATTACTACC 4 1 5' arm Osmerus_mordax mirnest 100 100 -35.6 ....((.(((((((((((((((..((.((((...((.(((((((..(((((((.((((....)))))))(((((((..(((.((((.((...)).))))..)))....))))))))))).))))))).))..)))).))..)))).))))))))))).))... (-35.6)