mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGCGGCTGGGAGGGGCTG CCGCCCCCCTCGCTGTCGGGCA GGCTCCCCTGAAGGCTCCGCCTCCGCCCCCCTCGCTGTCGGGCAGGTCCTCCACGTACAGCTGGGCGGCTGGGAGGGGCTGGCGGTAGACCTGGAAGGCC GACTTTCAATGTCAGTTTATTAAGAAAAACCAAAACAATAACATCAAATTGTTACATTCATTAACACTGTTTTCTGTACATAAAACCCATAATGTATAGTTCACTTTAAAGTGGAATGGCTCAAGTGTAAAAATAGGCACACCCTTCTGGTGCATGTGTGTAGGTGTGTGTGTTTGTGTAAATATATGTAGGTGTGTTTGTGTGTACACATATGTATATTTACACGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAACATTTTCTTCAAGTCGATGGAATTAGTCCTTAAGGTGAGACACTGAATGCTACTGTGCTGTCATCTGTCGTTGTTCGGTCATTGATTGCTTCTGTCTGTCATCTCTGTGTCTGAGCTGAGGCTCAGCCCAGCGATGTGAGCCAGGTCAGGGGAGAAGCGGGATGACGGCTGCGATTGGCTGGTCTGGGCTCCCCTGTCTCGTGATTGGACCATGGCCTGGCGCAGGCAGGATAGCCACTGCTGCTTGTTGAAGGAGTCGTTGGCCTGCAGGCTGTGAGACTGGGCCTTGCTGCGCCCTCCCACACTTACACGGAAACAGTTCCTCACTTTGTCGTTCCCGGACGAAAAGGCTCCCCTGAAGGCTCCGCCTCCGCCCCCCTCGCTGTCGGGCAGGTCCTCCACGTACAGCTGGGCGGCTGGGAGGGGCTGGCGGTAGACCTGGAAGGCCTCGACCCCCTCCTTGTCCTCTATTGGTCGAGT 3 1 3' arm Osmerus_mordax mirnest 100 100 -44.9 ((((..((...((((((((((...((((((((.((((((.(((..((.........)).))).)))))).))).))))).))))).)).)))))..)))) (-44.9)