mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCAGTGGAGATGCTGTTACCT TGTAACAGCAACTCCATGTGGAA GACTAACTGGTGCTCTCTGGGTGTAACAGCAACTCCATGTGGAAGATGCCTCTGTTCCAGTGGAGATGCTGTTACCTGCAGAGGGTCAACACAAG GGGGATTGCGTTGCTGACAACAGCCCCCTAAACTTGTTCTAGCTTCTAGACTCATCTGTTCCCTTCTTTGTCTTTCGTCGTCTCTGTCTTGTCCTCTGTGTTTTCACGTCTGTGCCCTGGTACTGCTGCCCTCTGGCATGTGTTGTTCTTGCAAACATCTAAAAGCCAACCCCTCCGAACTCTCCGCCCGCTGCGTGGGCCCTCGTCTGAAGGTAAAGATCATCGTATGAACTCATGCCACCGCCTGAAACAACAGAATAGTATTCTTTCGCTATAGAGGCAACACAACACTATTTGCCTGGCACATGCAAAATATATTTTGTCTGTTTGTGGCAGGTGTGTCTGTGTGCGCAGTCATGGATGCTGTGCTGTTAGTTGCCTGTAGGAGGCAGAGTTAGCTGTGAGGCGCAGGTGACTAACTGGTGCTCTCTGGGTGTAACAGCAACTCCATGTGGAAGATGCCTCTGTTCCAGTGGAGATGCTGTTACCTGCAGAGGGTCAACACAAGCCACTGACTTTTTACTTTGTTCTTGTGTAATATGAAAAACACCTCCTGTTTATTCAGCTCATTAACGTATTTTTCTCAAGCTTCTGTGCCGTATTTTTGAGAAATTGTATTGAGAACAGTTGACCTACGTTTACAGTAGTTATTTCACACTACACAATTTGTGTTTCTAGAAAAAAAAAAAAAAAGGAGTGTATGTTCCGGAAGCGTTAAGTGTGTCGAGTGGTGCTGCGGCTAAATGAGAGCTCAGGGGCGCAGGGTGATGACCTATGAATTGACAGCCAGTGTTTCAAAACCAACTGCCTGTCAGTTCTGTAGGCCACTGCCGTGTCTGTCCCAC 2 2 3' arm Osmerus_mordax mirnest mir-194 4e-19 fru-mir-194 0.0000000003 -37.2 .(((....)))((((((((((.(((((((((.((((((..((((((....)))..))).)))))).))))))))))).))))))))......... (-37.2)