mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTCTAAGCTTCTGTCATC TGACAGAAGATAGAGAGCAC CACTATTGGTAGAGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAAAAGATGATATGCATATAGATATATATAGTCACATACATACACATATACACATATGGATGGATCCAAAGCCAATTGCATTTTATTCCTTTGTGCTCTCTAAGCTTCTGTCATCACTCTTCAGCCTCTA AACACAAAGCATTCCATATAGTTTCCAAGCTATCTTTCTTCTCTCTTTCATTTATTCTAATTCTTTCACTGTGTTAAGTTCTTTGGAGGAAGATGAGAGAAGGAATGAAGGAGGCACTATTGGTAGAGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAAAAGATGATATGCATATAGATATATATAGTCACATACATACACATATACACATATGGATGGATCCAAAGCCAATTGCATTTTATTCCTTTGTGCTCTCTAAGCTTCTGTCATCACTCTTCAGCCTCTATTTCTATCTCACACTCTCTCCCATTATGCTCTAATTCTAGTCTTATCATGTGCTTGAATATCTTTTACTCATCTTAAATAGTTAAATGTTAGTTAAATTTTTTTGGCTGAACCAACAAGCAAATGATTTTGTTTCACATGTCCATGAAGAAATTAATTAAACTTTGATTGTTCTTCTCAAAATCACAGTTTGATTTCACTATATTATGAGTTTGTTGTTATGGGTTCCTTGTATAAAAA 3 1 3' arm Arachis_duranensis mirnest 100 ahy-MIR156b 3e-24 -48.2 .......((((((((...(((((((((.(((((((((((((.(((((.(((((..............(((.(((.((((............)))).))))))...........))))).)))))..)))))))))))))..)))))))))..)))))...))).... (-48.2)