mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTGTTTTTTTTTGTTTTC ATACAGAAGAGATTCGCAGACA TTCTTTTCATTTTTGTGTTTTTTTTTGTTTTCCTTTATTTATAAAATATTAGTTTTGTTTTGTGTTTTGCGACGATTGTGCTTATTGACCGATAGCAATCAGCCAAAATCATAAATCTGGAAATCGTTGTGGGTCTTCATGATAATCTTCAGGAATACAGAAGAGATTCGCAGACAGATCATCT TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGACCTATCGTTTTAAAAAAAAAAAGTTTATTTTCTTTTCATTTTTGTGTTTTTTTTTGTTTTCCTTTATTTATAAAATATTAGTTTTGTTTTGTGTTTTGCGACGATTGTGCTTATTGACCGATAGCAATCAGCCAAAATCATAAATCTGGAAATCGTTGTGGGTCTTCATGATAATCTTCAGGAATACAGAAGAGATTCGCAGACAGATCATCTACCCAGTCAAAGTCCGTAAATGTTACCGTTGCTGTGACTGTGGGAAATACCGGTAATTCCACTTTAACGGGAAAACCAGGAGGTAATTTTGTAGTCATGAACTCTCGCAACTTTTGAAATTGTTTAAAAGGAGCAATAACTTCCAAGACATCTAATAATGCTTCAACTGTCATAGGAAAATCTTCACTCATGGCTACGGTAGCTTTATAGGTTTTACAATTCTCCTTAGAAACTAAAACCCGTCCCAAACAAGGGCATTTACTTGAAGTATAGTTTTTGTATTCTTCCCATTTCATACAAGGGTTTGGTGGAGGAGGAAGTGATGTCCGTCTTTCAGGTTGTTTGGCTAATTGAGCTGGATCATCAGCAATAGCTGCTTTACAGAAATTCTCCACCAATGCTTTGTTCCGTTGCAAATCTTCAGGACTTAAATGCTCTCGCCTTTTTCNGTGATTCTAACGTAAGTCCACATATGTTGNTATAATCGGCTGGAAATTGACCACCATTTCTG 2 1 5' arm Euprymna_scolopes mirnest 100 100 -34.9 ...........((((((.((((((((((.(((((.(((((...)))))..((..(((((.((...(((((((((((((.(((.((((........)))).))))))..((.........))..))))))))))....)).))))).))..))))).))))))))))..)))))).......... (-34.9)