mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT CCGCTGCCGCTGCAGCTGCTG CTCGTCTTGCAGCCGCTGCCGCTGCAGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTCCCGAAGAGCCTGAACCATAACCACCATCGCCTGCTCCTCCAGCACCTGAGCCAGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGAA GCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCGGCCGCTGAGTCTGAACCGTAACCGCCATCGCCCCATCCATAACCACCGCCATATCCTCCAGCACCTGAGCCAGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCGGCCGCTGAGTCTGAACCGTAACCGCCATCGCCCCATCCGTATCCACCGCCTGATCCTCTACCACCTGAACCAGCTGCTGCTGCAGCTGCAGCTGATGCTGCCGCTGCTGCACTTCCTGCTGCACGATCATGGCCTGCTCGTCTTGCAGCCGCTGCCGCTGCAGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTCCCGAAGAGCCTGAACCATAACCACCATCGCCTGCTCCTCCAGCACCTGAGCCAGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGAACCGGA 5 0 3' arm Antheraea_assama mirnest 100 100 -48.8 .(((....(((((.((.((.((.(((((.((.((.((.((.(((((((..((.((((.(((.............)))...)))).))........))).)))).)).)).)).)).))))).)).)).)).)))))...))). (-48.8)