mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTCAAGGTTCACAGGAGAT AATCTGTTTACTTTGACCTAA TAAATGAACACAGGTCAAGGTTCACAGGAGATCAAGAAATATTATTCTTGTATAATCTGTTTACTTTGACCTAAATACCAGC CTGGACAACTTTTTAGCTCTTTACTTTTTCTTTTATTTCTGAAATAGGCAGGTTTTTTTTTTTTAATAAGTTTCCTGTTTTAAATGAACACAGGTCAAGGTTCACAGGAGATCAAGAAATATTATTCTTGTATAATCTGTTTACTTTGACCTAAATACCAGCTTTTAAATACTAACTCTGGCTTAAAATATTGCTGTAAATGGCAGCTCATTGAATACAGTTCTCAGTGCAATTATTTTTAGTTTTATCTGAGCTTCCATTGAACAGTGGTATTTTAATTTTTTTTCAAGGGATATTTTAAGTATTTCTAAGATTAATTCAATTAGTTTTTGTGTTGCTCTCAAGGCTAGAGCTAATGGTCTGCAGTCCTGTGTGATAATCATACGTATTCTCCGAGACCTCTGTCAACGAGTTCCAACTTGGTCTGATTTCCCAAGCTGGGCTATGGAGTTGTTAGTAGAGAAAGCAATCAGCAGTGCTTCTAGTCCTCAGAGCCCTGGAGATGCGCTGAGAAGAGTTTTTGAGTGTATTTCTTCTGGGATTATTCTTAAAGGTAGCCCTGGACTTCTGGATCCTTGTGAAAAGGATCCCTTTGACACCTTGGCAACAATGACTGACCAGCAGCGTGAAGACATTACATCCAGTGCACAGTTTGCTTTGAGACTCCTTGCATTCCGCCAAATACACAAAGTGTTAGGCATGGATCCATTACCACAAATG 4 0 5' arm Oryctolagus_cuniculus mirnest 100 mmu-mir-1898 2e-32 -24.1 ...........((((((((((..(((((..((((((((......)))))).))..)))))..)))))))))).......... (-24.1)