mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGAGGCGGGCGGATCAC AATCCTCCCGCCTCTGCCTCC GACGGGGTCTTGCTATGTTCCACAGGCTGGTCTTGAACTCCTGCGACCAAGCAATCCTCCCGCCTCTGCCTCCTAAAGTGCTGGGAGGCAGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGT GACGGGGTCTTGCTATGTTCCACAGGCTGGTCTTGAACTCCTGCGACCAAGCAATCCTCCCGCCTCTGCCTCCTAAAGTGCTGGGAGGCAGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCCCTACTAAAAATACAAAAATTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTATAGGG 4 0 3' arm Macaca_nemestrina mirnest Metazoa_SRP 8e-31 hsa-mir-5096 1e-19 -103 .(((((((.((((((((((...((((((((((((((((((((..((((.((..((((.(((((((((((((((((......))))))))))))))))).))))...))..))))))))))))))))))))))))...)))))))))).))))))) (-103)