mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCTTCAGATCTTGGTGTTTT GGTCACTTGGATCTGAAGGCTGCC AGGTTCTGTCTTGGGTCACTTGGATCTGAAGGCTGCCCCTTTGCTCTCTGGGGTAGCCTTCAGATCTTGGTGTTTTGATTACTTGC CCAAGGCCACGCGGGTGGGCGTGCTTCTCAACTGTGACCACGGCTTTGTCATCTTCTTCGCTGTTGCCGACAGGGTCCACCTGATGTATAAGTTCAAGGTGGACTTTACCGAGGCTTTGTACCCGGCTTTCTGGGTGTTTTCTGCTGGTGCCACCCTCTCCATCTGCTCCCCCAAGTAGGCAGGCTGTAGACACTTGGGCTGACTGCCTGCAGAGGTCCCAAGACCCTAGTGAAAATGCAGCAGGCAGAACTCTCCTTAGACAATTCCCCAAGAGGTACCAAGGATTGGGAGCATGGGAGGGGAGCTGGTGGGAGGGTGGGATATGGGATTTAGCCAGGAAAGGGGTGAGGGTGATTGTGTTGTAGGTGAGGAGGCATTTCCACCCCTCGGTGCCTATCAGGGCAGAGTGACCTGCTCCCCATTGTTCTGGAAATCTCCAGGCTGCTGGGCAGCTGGGCAGAGCTCTGGGGAGTGAAGTCATGAGTGCCCGATTCCTCTTAGAGAAAATCCATAGCTACTGTAGGTTCTGTCTTGGGTCACTTGGATCTGAAGGCTGCCCCTTTGCTCTCTGGGGTAGCCTTCAGATCTTGGTGTTTTGATTACTTGCTATAGATGTTTTTAAAATTCCAAAGTCATTGAGTTTCAATATTATATAACCTCCATTACCCGCATGTTGGGGCTCAATCTCCTGGTTATTATCTGTGCTTGAGGAAACATCCACAGCAGTCTCTCCCCAGAACAGAGTTTCCTAAAGAAGCATGCCCTCTTCTCACTGG 2 1 3' arm Macaca_nemestrina mirnest 100 hsa-mir-3614 6e-36 -41.4 ((((...(((..(((.((((.((((((((((((((((((..........)))))))))))))))))).))))))).))).)))).. (-41.4)