mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCA GTGTTCACAGCGGACCTTGAT GCAAACAGGCCTGCTTTTCTTCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAAATTTCCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAAAGATGGCAAATATCA AGCAGTGGTATCAACGCAGAGTAGCCAGATGGGCCCTCTACTATTTTTTTTTTTTTTCTCTTGGGAGTTGAGCAAGGGACCAACTGCAGCAAGCCACTGAGCGCTTTCTTTTTATGGCCATCACTCGGGCCTTATGTTGAACCAACACATGATGGAGAGATGCGCACCGTCCTGTGGAAATAACGCATTCGAAAAAATAGGTAATGTAATAAATGGGAACGCTTGCTTGAATTATGATGTTATGCACAGATGCTTTTAATGATGCATGATGCTCTGTGCAATGTTGGATGCTGACGCTACACCAGTCGGAAGAGGACGTAGATATTTTGGTGCAACATCTTTGCTGTAGCTTAGTTGTGCGATTCAGAACACTGTGGTTGCAAACAGGCCTGCTTTTCTTCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAAATTTCCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAAAGATGGCAAATATCATCGTTGATTGTTTTTTATGATAGCATAGCG 4 0 3' arm Cyprinus_carpio mirnest mir-124 3e-35 dre-mir-124-2 4e-37 -31.3 ........(((...(((((((.((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).)))))))).)))))))..)))........ (-31.3)