mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATAAATACACACACGTATAC GTACTGTGTATATCTATGTA GAACGTTTGTTTACCTGTTTGTGTACTGTGTATATCTATGTATATATAAATACACACACGTATACATCAAGGAAAATGTTAGAT GGGGCAGGCTACTTGTTCGCGAAACTGTTACTCACGTTTTTTTTTGTGCTTTGGGGTTAAGTTAAGAGTAGTATTTCTGCTTGTTAATTAGTGTATGCATGCGTTTTCCTCCTTTTAGCATATGTATTGTATTTTTATTGTGTCTGTTTTCTTCTTTTCAATACATTATAGGGTTGCAAAACGATTGATCGCGTTCAGAATGAACGTTTGTTTACCTGTTTGTGTACTGTGTATATCTATGTATATATAAATACACACACGTATACATCAAGGAAAATGTTAGATTTATATATAGATATACTTTATAAAATACAAAGTATACATGTATACATCCATAAGTGTGTGTACACAAACATTTATTTTGTACGCGATTAGTCGTTTTGCAGCCCTGCATTTAAAGCTGGTTTTGATTGAGAGCCAATCGCAGTGAGCCCCTGTAGAGATTCAAAATTTCATTGGCTGGCAGCAGGCCTGATTTGCATATCACGTGATCAGTTGAGTGCGTCAGTACCTGAAGTAAAAATCCCATTCGTTTTCTTCATAAGACAAGATCTACTGTGAAGCCATGAGGTTAATTGATATTATATGCATTTGTCGAAGCCACCAGTGGGCATTGTTTTAACTAATTTTGCAAATATGTTGAAAATAACCATGATTCTTAAATAAAACATGTAAGTGC 2 1 3' arm Cyprinus_carpio mirnest 100 mmu-mir-467g 4.0E-6 -21.6 .(((((((.....(((...((((((((((((.(((.((((....)))).))).))))).)))))))...))).))))))).... (-21.6)