mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGGCTTTGTTTATCTCA GGATATACCAAGTTCAGTTGTG TTCAGTTTATGGGATATACCAAGTTCAGTTGTGTCTAATAAATTGTTAGTATCCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAACAGTG GGGATTTAAATTAAATTTCAGTTTATGGGATATACCAAGTTCAGTTGTGTCTAATAAATTGTTAGTATCCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAACAGTGAAAATATTGCAACAAATCTATGAAGTGCAGCTCAACTTACCGGATTGACTAAACAGGAATTAAAATCTTTCTGCATATCTGAAACGGACACACGATCATGTGGTCTTTTGGGGCCAGAAACAGACGTTACAACGGTGGAGAGATCCAAAGATATAGTCTAAAAAATATTATTATATTTAATTAATATTATGTGTTAAAATAGAACTTACCTGAGTATACAAAGGATCTTGAACCTCATTTGAATAATCACGTAATTGGCCAGTAGCTTCTAAATACTTCTTAATGATATCAATTTTCTTTTCAGAACGGTTTGTCTGCTTCATATAGGATAAAGTGTTGACATCGATAGGGAAATATCCAACTGTAGCGCCATATTCAGGGCACATGTTGCTTATGGTTGCACGATCAGCGATACTTGATTCAGCTACACCAGGTCCGTAAAATTCAACAAATTTTCCAACAACTCCTAACTGGCGTAGATGCTTCGTAATTGTTAAAACTAAATCAGTTGACGTAACTAAGGGACTTAGTTTACCAATTAACTTGTAGCCTATCACTTCGGGCAATAACATGGAAATTGATTGACCCAACATAACGGCTTCAGCTTCAATACCACCAACACCCCAGCCGAGCACTCCTAAACCATTGATCATTGTA 3 0 3' arm Teleopsis_dalmanni mirnest mir-318 0.0000003 dan-mir-318 0.00000002 -27.1 ......((((((((((.((.(((((((((.(((.(((((.....)))))....))).))))))))).)).))))))))))..... (-27.1)