mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTATTTACTTTGTTTGTTG AAGAACTTGGAAGATGTACTA TAGCTTCCCAGGTCTTAATATGTGTATTTACTTTGTTTGTTGTGTATGACCAATTTGTTAAAGAAAAGAACTTGGAAGATGTACTAGAAGATGTGATAGAAAAT GAATTTTGAGAGAATTTGTATTTGCATTTCTTTCGTCTTCATAATATTGTTTATGTGTTTATGTGTTTATGCTTTCCTATTTTTTTCAACAATGCAAAAGTTGAAGTATTATTGAAGTTAATCATTGTTATCAATGCTAAAAATATCGAGCAATGGTGGCTTACGAGGAAATCGCACGCTCAAAATACAAAAGTAATTGGCTGCTGTTACTTGTGTTAGCTTCCCAGGTCTTAATATGTGTATTTACTTTGTTTGTTGTGTATGACCAATTTGTTAAAGAAAAGAACTTGGAAGATGTACTAGAAGATGTGATAGAAAATGTCAATAGGAGTGTAGACGCTTCACAGTATCGTATGGTATGTTATTATACCACTCCAAATTCAGATGAAAAAGATTATTTACGTTTGGTTGATATAAAAAAAAATCTTTGTTCACACGTCAACATAGGAATCGTAAATGTTAAAAACTCTACATTAATTTTGTCATCAAACTTTATACGTTTACTTAACGAAGAGCTTGCTACTTTACGAGTTACTGATCCTTCATTAAAAATTCTGTTATGGGTGGGTGGTGGAGGTTATGCAGAGGAAGGTTTCGCATCAATGGTTCGAAACCATAGTTCGCGTAAGATATTTATAAGGTCTTTAAAAGAGGTTTTGCATAAATATAAACTTGACGGAGTTGACTTAGATTGGGAGTTTCCTCGCGCCTATAATAAGCAAAGGCAGCATTTTTCCCAACTTTTAAGAGAAATCAAGCAAGAATATATACGCGAACGGAAAGACTATTTGTTGTCAGTGGCAGTTGCGGCACCTGAAGGATTGCTCTGTTTGCTACGATGTGAAGGAGCTGAACTCCTACGCAGACTTTGTCA 5 0 5' arm Teleopsis_dalmanni mirnest 100 100 -13.1 ....(((.((.(((((.....((((((((.((..((((.((.....((((......))))....)).))))..)).))))))))...))))).))...)))... (-13.1)