mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTTTGTTTGGCTTTAGTA CTATTGTACGACAAATAGTAGG ACATTTTGATATCTTTGTTTGTTTGGCTTTAGTAGCATTGTACTGAGTTACTATTGTACGACAAATAGTAGGCATTAGTGGT ACATTTTGATATCTTTGTTTGTTTGGCTTTAGTAGCATTGTACTGAGTTACTATTGTACGACAAATAGTAGGCATTAGTGGTAGTGCACGAGTGCACGAATATATATATACCGCGTACATTATATAACCAAAAAAACACTCAACCTTTTGAAGTATAGTTGTAGCAGACTCTGTTTCACTTGAACACTAACCTGACAGAAGTCCCTAGTTCTTGCTAGAACACCTTGCTACAATTAGAAATGAACTATGATGAACGATGAGCTATGAAGGAATGAGCTATACGAAGAACGAATATTACTGACCAGTGGTCTAACGAAAAAAATAGCTTCTCTTTGTCAGTGAATAGATGGTCTACATGCTTAGTTACTTCTGTTTTATTCAGTTATTTCCTACCCTGCAAGGAACGGATCAAGAGTCTGTTATAGCCGTTTGAATTTCTATTTTTATATACAAGCAACTTGGTTTGCCTAGCAATATAGTTTTTATAAATAAAGCTGATTTCAATACC 4 1 5' arm Montastraea_faveolata mirnest 100 100 -18.3 ((...(((((.((((((((((((..((..(((((((..........)))))))..))..))))))))).))).)))))..)) (-18.3)