mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGAGTTGTTTTTTATTTTA GNNTGATAAACAATTAAAAAG TAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAAACTTGTAGNNTGATAAACAATTAAAAAGCAAAAAGAGAATAGATCCTGTGTCGACATCATGCCCTTTGTCTGAATATATATCTTAAAGAATTCTTATACATATATGTACAATATTTGAGTTGTTTTTTATTTTATTATTTTATCCTTTTTGTCGTTCACTCTT GAAAGGTAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAAACTTGTAGNNTGATAAACAATTAAAAAGCAAAAAGAGAATAGATCCTGTGTCGACATCATGCCCTTTGTCTGAATATATATCTTAAAGAATTCTTATACATATATGTACAATATTTGAGTTGTTTTTTATTTTATTATTTTATCCTTTTTGTCGTTCACTCTTAAGTTAACATGCACATTTTATCACCAGAGATATTTTTTGTTTTAATTTTTGCCTTTGTAGTTAAACAAAAACAAATGGTTTGTAATTAATGTGTTTGTACATTTTTAATACCGTCTTTTAATAATTTTAGTGNTAAACTCCTTATACCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 0 3' arm Lutzomyia_longipalpis mirnest 100 100 -29.1 ..(((..((.((((((((.((((......((((..(((.((((((((.(((.(((...((.((.....)))).))).((((..........))))((.((((((((..(((.......)))...)))))))).))...))).)))))))).)))..))))..)))).)))))))).)).)))...... (-29.1)