mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTTT AGTTGTGTATGGACATCATT TGGGACTGGGGAGTTTGGAGCTGATTGTCCAAACGCAATTTTTGAGTCTGCCTAATGCTAATCCAGGAGTTGTGTATGGACATCATTCTTCAAACTCTCACTCAC CGGTCTCATGGTTTATTGATGGAATGTGTTTGACTGTTTGTTTTCAAAGCGGTTTTTTCTCACAGTAAAAGTGCTTTACCCAGGTTTCTCTGTCATTGTCTCTGACTCTGCTGGGACTGGGGAGTTTGGAGCTGATTGTCCAAACGCAATTTTTGAGTCTGCCTAATGCTAATCCAGGAGTTGTGTATGGACATCATTCTTCAAACTCTCACTCACACACAGGGAATGCATTCAAATAGGGTAGGAAATGGGACAAAAGTGTTGGAAAACCCAAAAATATTTTGTGAAATAATGCTAGGAAAAATGTCTAAACAATAATTTGTTCATTACAGATTAGTTATATTTGCTTGCAAGTTGTATATATTGGCCTTATTTCAGTAGCTGACATGATCCAAATCTGTTATAGGCCCAAATATTAAAGGCCCAGTAAATGCTATACTTCACTGCACCTTGAAAGTAGGCCTATATCAGCTTTAAAAATAATATCCTCTTTTTGTAGATTTCTTGACCATGTATTTGTTTTCATGTTTATACAAAAAGAATAAATACAATTGCAGAAATTCAACATGATTAATGTTCTAATTTTAACGTTCTCATTTTGAAATATGAAGGTGTATTGACTATATTAACAGCCATGTTACAAATATTGGACTACATGGATTTACTTCTGGTTTGTTTTGTAGATCATGTAGAATATAAAAATTCAGTCAATGAGCCAATCACTGGCTGCAACCATTGAACTTATACTCAGTAACAAAGTCATGAAATTGTCGGCAGGCTTTCTTGTTTATGTTTGCTTGGCACTTTTTCTCATCT 1 1 5' arm Esox_lucius mirnest mir-219 0.00000002 fru-mir-219-2 0.000000000005 -41.1 ((((....((((((((((((.((((.(((((.((((((((((((.((..((.....))..)).)))))))))))).)))))))))..)))))))))))).)))). (-41.1)