mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTACCGTGAGTAATAATGCA CATTATTACTTTTGGTACGCG TGCTTCACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTG GGGGGAGCGAAGGAACAGAAGAAAAATAGATTCTCGTAAATGGTGGGAGATCGAGACGATGGCGAAACAGGCCTAAAGGCCAGTCGGTGAAAGCAGGTGGTGTGCCAACCGGGGAGTCTGGACGGTTGGCATTTTATTCTCCATTCCTTGATCGCCCTGAAAAAATGGAAAATATAATATCTCAACCTCTACCTCAAAGCCAAATGTATCCGAGGAATAATTAATGGGATTGAGGACTGTTGGCTTCTCGTACCCAGAGCAAGGACACAAGACACAAGTTTCTGCCTGCTTCACGGTCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTAGGCCAGTCTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCACTGTGGCTGTCAAAGCCAACGGTCAGCCAACAGTGACGGACAACACCTCCCCAATCCTGTATCATGTAAAGAAACCCAAGAAAGCAGGAACGCAAACTTTTTGCCATTTTACTATAGCCTAAACATAAGGTGTATTGTTTAATTGCTTACTATAAATACATTGTTACATGTTGTAGGCTGTAGGCTGTAGGTCTACAGTGTTGGTGATAAATCCCAAAAGGTCGTGGGGTGAGGGCCACACTGACTGCTTTATTCAAAGAATTATCCTAGTCTGTATATTTGAAAGTTATAACTATGTTGCTTGCAAAAATACATTACCTGTACCTATGTCTGACTGTTGACCTATGGGCTATTTATGTCGGATCTTGTTTTGATAGCCTACAATAAAAGCGAAATTAGGCTGC 2 0 3' arm Esox_lucius mirnest mir-126 9e-32 dre-mir-126a 8e-35 -28.4 ....(((((((.(((((((((((.(((((((.((...)).(((.....)))))))))).))))))))))).)))))))... (-28.4)