mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTCGGTCGGTCGGGCGGT TGCCTGCCTGCCTGCCTGCC ACTAAGCACTCGGTTGGTTGGTCGGTCGGTCGGTCGGGCGGTCGATGAATCGATGGATCAATGAATCGATGATACCACCAATTGCTGTTGTGCCTGCGTTGTGTGTCTTAGTCATCTCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCCGCCTGCCTGTCCA TCGGCACGAGGCTCCATGTGTCTACGCATGTGTAACCTCTCACTCAAAGCAGTTCTTGCTGAGGTGGTTCCGTAACGCCCACAGTCTGCTCATCTTGGTATCTGGCACCTGCTATATGACCTAATCTTAGCAACCGCGCTGCTGCTGCTACTGATGTTGTTGCCGCCACTTCTCCCTTTTCCCTACCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATCCACTCACTTGCACACACACACACACCGTTAATAATTCCGACCACCGGTTGGGTTATTGAGTGGGTGAGTGAGTGAGTGAGTAAATGAGTGTGTGAATGGCCTGGATTCGGGCCTCATTACCGATCCATCCACACTAAGCACTCGGTTGGTTGGTCGGTCGGTCGGTCGGGCGGTCGATGAATCGATGGATCAATGAATCGATGATACCACCAATTGCTGTTGTGCCTGCGTTGTGTGTCTTAGTCATCTCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCCGCCTGCCTGTCCATCTACTTACTGACCAGGA 4 1 5' arm Taenia_solium mirnest 100 100 -49.4 .....(((...(((.(((.(((.(((.(((.((.(((((((..(((((((((((..........))))))(((((.((....(((.((...))..)))..)))))))....))))).))))))))).))).))).))).))).))))))....... (-49.4)