mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTTCCTAAATATAAGTC CATATATTTAGGAACGGAGG CCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTTAGGAGGTTCCACTAGNATATATATATAGACATACTTTACAGTGTAGATTCATTCATTTTGCTTCGTATGTACTCCCTCTGTTCCTAAATATAAGTCCTTTAAAGATTCCACCAGGGNACTACATACGGAGCAAAATGAGTCAATCTACACTCTAAAGTATATCTTTGTACATCCGTATGTAGTTTGTAGTGTAATGTCTAAAAAGACATATATTTAGGAACGGAGG CCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTTAGGAGGTTCCACTAGNATATATATATAGACATACTTTACAGTGTAGATTCATTCATTTTGCTTCGTATGTACTCCCTCTGTTCCTAAATATAAGTCCTTTAAAGATTCCACCAGGGNACTACATACGGAGCAAAATGAGTCAATCTACACTCTAAAGTATATCTTTGTACATCCGTATGTAGTTTGTAGTGTAATGTCTAAAAAGACATATATTTAGGAACGGAGGGAGTAGTATTTAGGAACGGAGGGAGTAGTTGCTAAAGGTCGTTTGCTATTTATAAGAGTTTTGCAGGTGGGCGCCTGTCAGACCGCTGTTAAAATCTAAAATGTGGAATTTTGTGATACCTTGCCTCCCTGAATGTGGAATTTTGTGAAACTATGTCTTAGTGTGGAGTTATGTGATAACTTATACAACAAATGTAGAGTTTTGTGAAATTGTACACCTTATAGTGTGGTACAAATTCAAAATTAGCAGCATTCTTTATTTGATTGTGCCAGCATCTCATCTCCGTACTGCCTAAAACATGTTTGTTTTGTCTTGATGCTTTAAGGGTCATGCTTGCAACCTCCATATTCTGCACATGCACTT 1 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 1e-30 tae-MIR1122 3e-28 -100.1 .((((((((((((((((((.(((((((((((..(((.((((((.(((((((((.(((.((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((.((.((.((((.........))))..))...))..))))...))))))))))))))))))))).)))))))))).)))))))).))).))))......)))))..)...))))).))).))))))))))).)))))))))))))))))) (-100.1)