mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTGAAAGTAATGGAGTAT ATTTCTACTTTAGGTAGTT TTTTTTCGTGACGTGAACGATTCAACTTTTTATAGATTTGTGAAAGTAATGGAGTATTTTGAATATTTCTACTTTAGGTAGTTTGTAGTCGTGTATATCATGGATTAAAGTATACA TTTTTTCGTGACGTGAACGATTCAACTTTTTATAGATTTGTGAAAGTAATGGAGTATTTTGAATATTTCTACTTTAGGTAGTTTGTAGTCGTGTATATCATGGATTAAAGTATACATTGTACAGTGAAAATAGAAATCTTCAACTCAAAGGATAAGCTAAAATTTTAATGAAAATCTATTTGAAATTAGAGCGTAGACTTCGAGTATAGAATATGTCAAACAATAGCTTTTGGGGTAATTTGGATTCGTATTCAAACTTGCAGCAGCAACCAGCTGAAACTTCACAACCAAATGACGAATGGAGCTGCAGTACAGATGATTGGAATTATATTGATCAGTCATCAACTAATAAAAACGCTAATCTACAGAAATTCAATTCTACTATAAATTCAGATTTAACTCTGAATAGCTATTCTGTCCCGGACACTCATAATGGAACGACTCATTCTTTAGTTAATTCAAGTAGGCCGACATATAATTATAAAAACGGAATTGAAAATGAACAACAAACCTTTCCTGTTGTTAATAATTGGTTCCATAAACCTGAAAATCAATTTGAACAAATAAATAATGTCCAACATACATTTGTTAATCAACATACTGATAATAAGAAAAGTGACAATATTATTGAAACCGAAGACAATTTCTGGGCGGATGTTGAAAATAGTGAAATTCTTCCACCAGAATCATTCCAGAATGAATCACTTCAACTTGCAATGAATAATTTACAACTAAGTAATGAGTTACACTCCAATATATATGATAACAATGTGACACATAAAGACACTGAAATAACAAAAATGAATTCTGCAGAAAATGATGATGATAGGCCACCAGTTGGACTTGATCGATTAGTTACTGGGCAAACAAAATCATTTGAAGATTATTCC 4 2 5' arm Myzus_persicae mirnest 100 100 -22.8 (((.(((((((.(((.(((((.........((((((((....((((((..((((((((...))))))))))))))....))))))))))))).))).)))))))..)))....... (-22.8)