mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTTGGGATTTTTTAGATCAG GGCCTACTAAGTCCCAACAT GCGCCCATTATGGTTGGGATTTTTTAGATCAGCAGTTATTGCTACAAGTCAAAAATTTATTATCATCTACTGGCCTACTAAGTCCCAACATAATGAGAG ACAGTTTCGGTCCGGATTCCCGGGATCACTCGGACTCGGTTCACATAAACAGTTTCATTTATATATACTTTTTTTTTATTTTTTGATTTAATTAATCAATCTGTGTGTGCGCCCATTATGGTTGGGATTTTTTAGATCAGCAGTTATTGCTACAAGTCAAAAATTTATTATCATCTACTGGCCTACTAAGTCCCAACATAATGAGAGTAAAAACCACTGACGAAATGAATTTATGTGAAAATATTTGACTATGCTCACAATGTAAAAGCAATTTTAATGTTTTCTTTCAAAAGTTTGTTTAAATGTTATTCCGCAGCTGCAAGACAACAAAAGTAATAGCCATTCGCTGAATAATTTGTATAATCTAATATTATTGTGCTCCAGCCTTATTATCAACGTAGCTGAAAGAACATTAAACAGAAACAAAGATTAGATTAAAGTTTGACATGTTGATATTCAAATCTGAATTCATTTGTTAATTCAATTCAAGTCTACTGCCACAGTAGCATGCCATCTCGTTCCATTTCATGATTAAAGGGCAGAAATACTTTTCTATTCGGTGTAGTGTGTATCTTTCTTTCTGTGTAATTTTTCAAATTTTAAAATGGATAAACATTTTCTCGATAAACCTTTTGATAAGGTTAATTAAAAAAGCAAATACTTAAAAAGTAATGCAGAATATTCTTTGGTTTATGATTCATAAGTTTTTGAAATAATTGACGATGATCAGTCTTAATACCCCGGATTTATTAAGAGTTTTAGTAATATTTTATATTCATCTTACTGATTGTCTCACTGATTGTCCTACTGACCTACTAATGTATTATATCCTGTAGATTTTATTTAGCATTTAGTCAGTGCAAAA 3 1 5' arm Drosophila_willistoni mirnest 100 dsi-mir-193 9e-23 -21.8 .....(((((((.(((((((((..(((.((((.((....((.((.((((.....))))..)).)).)).)))).)))..)))))))))))))))).... (-21.8)