mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCGCACGCACACACACACAC GTGTGTGTGGCTGTGTGTG AATACATGTATGTGTGTGTGTGGCTGTGTGTGATAAAAAGATTTAAAGAAACGCGCACGCACACACACACACACACTGAAAG AGTTTTCGGTCCGGAATTCCCGGGGATCTGAAATATCATCAACATAAACATATGTATAATATATATATATATATATATATCAATACAATTATCCTAAATGTATATGCCATATAAGCACATGCATATACATATTACATTGATAACTAAAGTCACATAAGCAAATCAGATAAGCAATTGATATAATATATATATATATATATGTTTATATGTACAAGTCCTAATTTTTGAGATGGATTCGTTGTTGTGTGTATATATATATATACTTAGATATATAATATATATATATTTAAATACATGTATGTGTGTGTGTGGCTGTGTGTGATAAAAAGATTTAAAGAAACGCGCACGCACACACACACACACACTGAAAGAAATGAAAAATAATCTATTGTAAATTTCACAATTTCAAACATATTTTATAAATGTTTATTATTATTATTTTGTGGTCCACTCTTTGTCAACGCCCCCGCCCCGCCTGCACCCTGCCCTTTCTTTATACATACATATAGAATATATTTAAAAATCATTGTAAACGATAATTATGTAATAATTATGTTGTGAAAAACTGTGTAAAGAGACATTGGTCGAAAATTGAGATAAAGAGAAAAATAATGATGAGGAGAAGGAGAACCCATGAACCGAAAGGAATAGCGCAAAAGAGAAGAAAGAAATACTATAATATATATATTGATATAATACTAATACATAATAATAATAATTATGATAATGAAATGCCACATTTGTTTTAGGTTAAGAAATAGTTTTGGAAAGGAGAGGTAAGGAGTGTTAGGGGGCTTAGGAAAAAGATGGCTAGATTCGTACATGATAATTAATGATTGGTTATCGTGGGGAGAGGAGAGCATAATTGCATTAAGTCTTAGAATTTTGT 0 2 3' arm Drosophila_willistoni mirnest 100 100 -30.3 .......((.(((((((((((((((((((((...................))))))).)).)))))))))))).))...... (-30.3)