mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCGTCCCAAAATAAGTGT AGTTATTTTGAGACAGAGGGA ATGTCAATTCCACTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTTAAGCTTAGTACAAATTTATAATAAAGCTAATACAAAGTTGAGACAGTTATTTTGAGACAGAGGGAGTATATGG TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAATTGAAAATTCAATAGGCTTCATTACAACTTACTCCTTAAGGAATACTCAAAATGATGTCAATTCCACTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTTAAGCTTAGTACAAATTTATAATAAAGCTAATACAAAGTTGAGACAGTTATTTTGAGACAGAGGGAGTATATGGTAAAACATTCTCAAAATGTATAGGCGTCTGCAGCAAGTATTCATACATAGCTCGCATCAACAGCAGTACGGTTTCAACCGGGCAACTGGAAGATGAATGACGTTTTGATGGTCTGGACGGGGTCGGTGCAAACTGTANCCAGACAACTCACTCCTGGTCAGCTTGGGGACCGATATGGCTGGGATACTTGAATGAGATATCGGTCCACGTGCTTTGTCCTTCTGTCAGCTCCTTCACCACCGATGCCACCTCGTCGATGCCCACCCTCACCTGCTGCTTGCTGTCCCTCTCTCGGATCGTCACCTCCGTTGCAGAATCGACCGTTACTGCAAAAGGAACACCGATCTCGTCCGTC 4 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 8e-30 100 -29.6 ......(((((.(((.(((.((((((((.((((((((.(((.(((....((((...)))).....))).))))))))))).)))))))).))).))))))))...... (-29.6)