mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATACAATCTACTGTCTTTC CTGAGGTAGTAGATTGAATAGTT AACATGGATGCTGTCCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTTGTGTAACCTCTTTTTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCCAAGGAGACAGCCAGGTC GGGGCAGAGGGTGTGCTCTACTCCTCTCTTTTCCCTTCTTCCCGCCATCACGGCTCCCTTCTCCTCCAGTCCTCCGGCCCAGCCCGCCGCTCACGTACAGGCTCCAGGAGAGTTACCTTTGTGGATCTTTGAAGCGGAAGCAACATGGATGCTGTCCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTTGTGTAACCTCTTTTTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCCAAGGAGACAGCCAGGTCAGCCACTCGCCGACTGTCACCTCCAGATGGGCAACCATGCCGTCCAATCAAAATGCACGCTTGCAAGCAGCAATCAACACAATGCACTATGTCGAGCATTGTTTTTTTGTTTGTTGCTAGAGCAGGTTAATTAGGTCTACCAGGACGTGAAGGTGTGGTGTGTCTGATTTGGGTTCTGTCAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGTGGACGGGATTGCACCCTGCTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTGAGGAGCTCACTGAACACTCATCAATGCTCAACACACTCTCATGATGGTATCACGTTTATTTGTAGATTTCAGAAAGACAGGAGCGAGTAGATATGTGCTGCAAAAAGGAAAGGGATGAATTGACTGAAATGACAAAAAATATGTACATCTCAATAAAGTCATATATGCCTC 1 2 3' arm Sebastes_caurinus mirnest let-7 4e-38 tni-let-7e 9e-45 -41.9 .........(((((((((((((..((((((((((((((.((((((((((((((....))))))........)))))))).)))))))))))))))))))))))..))))...... (-41.9)