mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT CTCACCAGACAGCAGTGTGGCTG TCCTCGTCCGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCGTCTGAGCTGGAAGGCTTCGGCTCTGGTTGCAACTCACCAGACAGCAGTGTGGCTGACTTGACA CGGGTTTAACGTCCATTTCAGGACTTTCAGACACTTCATCACCATTTAGCTCATAAACGCCCCCAGTGGATCTCTTCTTCTCCTTTGTCTTTTTTCTCTGAGAGTCCACGACCGTCTCCTGGGAAGTCGGTGGAGTCGGTGCAACACAAACCGGTGGAGCGCTTCCTGGTTGGCTCTTCTTGGCGTACTTGGCCATGAACTCAGCCTCCTGCTGCTCCAGCCTGGCTAACTTGGCGCTCATGGTCAAGCCGTGCCTGGCTCCTTTGTGAGCCGTGCGTCCTCCACAAGCCTTCATTAGATCAGCATCGGAAAGCTTTGTGGTGCTGGAGAGATCCAGTTTCTGGTCGTCATCCTCGTCCGAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCGTCTGAGCTGGAAGGCTTCGGCTCTGGTTGCAACTCACCAGACAGCAGTGTGGCTGACTTGACAAAGCATCCATAAAGTTTGGCTTTAGCCAGCGCTCCTATCCGTGGCTTTTTATTGGAGATCATCCCATCCTCTTCATCTTCCTCCACCGTCTTCTTCAACTGAATACCGTTCTGATCAGACTCCATCTGCAGACTGGAAGACGCCTTATTGAAGACATGATCCCACCAGTGGAAGGTGAACTGCTCCCCTTCCTTATGACCAACCCCTCCTTTGCCACATTTCACTTTGACCTTG 2 2 5' arm Sebastes_caurinus mirnest 100 100 -39.5 .....(((..((((((.((((((((((.((.(((.((((..(((.(((((....))))).)))..)))).)))...)).))).))))))))))))))))...... (-39.5)