mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTCATTTATGTTGATAAG TATTAATATAGATGAGACGTAAA TCTTTATGGATGCCTTGGATTATATTAATATAGATGAGACGTAAACCAGTTTACATAGTTTACATTATATACATAATATAGATTATTTATATTTTACCTATAGATGCATAACCCTGATGTTAATATATCGTCCTCTCAAGAAATATCTATAATTTATGTCATTTATGTTGATAAGATTAAAGGAAAACCGTCTA TGTCTTATTTGGGGAATGATACATAATTGAACATGTATTAGCTGTATATGACTGTGTTGACTTTTGTCATAAGCTATATTTAAATTACATCAATGTAATCAATGTAACTTCGTTGTAAAATAGCTTGAAATTGTAAAGCACTGGATCGTACACTGTGTTACAATCTCACTTGTGTATATTGCTGGAAAGCATCCTTTTTCATGTAGACAATAACAAGCAATATAAATTATTATAAATTGGATAATACAATACAAAAAATAAAGTTATAAAAATTGTTAATATATCTGACTTTAGTATTGATAAAATAAAAATATAATATTAAAAATAAAAAAAAATAGAATTTTTACTATTTCTGATAAAATTTGAATCTTTATGGATGCCTTGGATTATATTAATATAGATGAGACGTAAACCAGTTTACATAGTTTACATTATATACATAATATAGATTATTTATATTTTACCTATAGATGCATAACCCTGATGTTAATATATCGTCCTCTCAAGAAATATCTATAATTTATGTCATTTATGTTGATAAGATTAAAGGAAAACCGTCTACTTCTAATTATACAAAGTAAACAAAATTGCAAGGTGCATTTTGATTATAAAAATTGTGAGTTTTTTTATAACGTCTCTTACATTTAAATGGTT 1 2 3' arm Solenopsis_invicta mirnest 100 100 -32.7 .....((((...((((.((((.(((((((((((((..((((((((..(((.((.((((((((.(((((....))))).)))))))).)).))).....((((((((........((((((....)))))).............)))))))).))))))))))))))))))))).)))).))))....))))... (-32.7)