mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTATATGTACATGTACATGT ATGTACATGACAGGATTTACT TGGAGAAAAAGTGTATATGTACATGTACATGTATATGTACATGACAGGATTTACTATAAAATA AGAACGACATATTTTTTAATCAATATTTTGATCAATATATTTTTGATAATATATTATTGAACAAAACTTAAAAGCTTGAAATGTATGTAATATCAGCATAAATGATACTATACTTTTAGATCCTTCTTTGAGGTATTGTAAATATATTCGATTTTTTATAGTGTTTAGAGGTTTCCAGTGTAAATTTTAATTACCAGTGATAAATTGTCTTTCTATTTAGCAGATACTTGCCAAACTAAACAATGTAAATGATATATGTAAGGTTAGAATTTTTAAAATCGTGCGAGAATTTACTAACAGTTGTATCATATTGGAGAAAAAGTGTATATGTACATGTACATGTATATGTACATGACAGGATTTACTATAAAATACGATTTATAAGAATGTAATTATTACCATTATGTATAGATCGCACATATGTCTTGGATATATGTAAATCAAGCCTAAAAAATCATAACGAAATTGTTCAACAATAGGAGGATGCTATGATAAAAAATTATTATAATTGCAGAGCAAATTAAAATCGTTAAAGCATATGTATAAAGGAACACTTTGAGGAACCAATTGCGATTCTCTTTCTTCCATATATTGCAATTGCAGACTTTTTTCTCCGTTAAAAGTTATTACAAGTGATATCGCTTCCGTTGGTATTTAGGAGAAACTTTATAATTCTGCTTTATAATATATTCGTATATACATATCTTAACAGAATTAATAATGTTTTATTGTACTTTGAGATACTTCCTCAATAGTTCGCTATAATTATAAGAAAACACAATGGTTACTTGGACTTATTATTAATAAGTCCAACTTGAACTTATTAATAAGTTCAAAGACGAATAAAAACCAAAATCAAAATTTTTTCTTAGCTAAAGTTTCTATGA 4 2 5' arm Solenopsis_invicta mirnest 100 mmu-mir-466l 0.0007 -15.5 .........((((.((.(((.(((((((((....))))))))))))..)).))))........ (-15.5)