mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTGAAGGTAATGGATTTG AAGCCTTTGCCAAATGCATAGT GATATAGTGTAGCATTATAGCTGTGTGAAGGTAATGGATTTGATTCCACACACTAAGTGATAAATTGTATACATGCACTGTAGGTCACTTTGGATAAAAGCCTTTGCCAAATGCATAGTTGTAAGTTTATCTGAGCT GAAGACCTTCTCAAGTGTGCTACCTACATAAACTGTTCTCCTTCTGATGAGCTGATCAAGAATTTTTGGACCGTTTTCTTTGAGCTCTCTGAAGAAGACAAGAGGAAATTTCTGGTGTTCATGTATGGAACGGACCGTGTACCTGCTGGAGGTCTCTCAAAGTTGACTCTGAAGATTGTGCTGTTAAACGTTCCTGATTCAGATGATCGTCTACCAGAAGCCCAGACTTGTTTTGGCACATTACGTCTTCCCAAATACAGCAATATCGACATACTTCGTAACCAGCTAATACATGCTGTCAGCTTTTGTAAGGTTTTTGGACGGGCGTGACAAGGTCAACTTACCTTAAATGAGCTTGGTCCGAAATATATGTAGTCAGCTATAAGCTGGAGGCTGCTTTTTGTATGGCTTTATGATATGTTATATCAATTAGATCTGTAGCTCAGTTGATATAGTGTAGCATTATAGCTGTGTGAAGGTAATGGATTTGATTCCACACACTAAGTGATAAATTGTATACATGCACTGTAGGTCACTTTGGATAAAAGCCTTTGCCAAATGCATAGTTGTAAGTTTATCTGAGCTTCTTATATTTGCAAATTTACAAATATGGCAGTATAGATTATTTCTCACTACTTGGGGAAAAACGTATTGCTTAATGCTGCTTTTGAAGATTTATTGTGACNAACTATTTATACAGTTTTGCTTTTTATGCATGTAAT 5 1 5' arm Misgurnus_anguillicaudatus mirnest UnaL2 0.00000003 100 -31.9 ....(((...(((.(((((((((((((..(((((.((.(((...((((......(((((((........((((.....)))).)))))))))))..))).)).)))))...))))))))))))))))...))).... (-31.9)