mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGGAGGCCTTGGCCAAGTG TTCGCCAAAGTCAATCCGT TCGGCCTGGTCGATGAGATTGCCAGCAGCAAGGAGGAGGCCTTGGCCAAGTGTGCTGATTTTATTGCTACATTCGCCAAAGTCAATCCGTTGGCGCGCTCCTTGACCAAGCAACAGTT TGCGTAAAAGTTATTAAGCTTGGTGCCGCGTGCCACAGTTGCTTGCAGGCACATGTCCAGTGCCACAAAGCTAACAACTGTGGAAGTCAATGATAAAACTGGCATTGCAACACTTACCATGAATAGGCCGCCTGTAAATGGACTCAATTTGGAATTGCTGCGCGACCTTCAGCAATCAATTGAGGAAATAGAAGGCAACAAAAGTTGCGGATTGATACTGACATCATCAAATCCAACAATATTCTCCGCGGGTTTGGACATCCTCGAAATGTATAAGCCGGACAAGGAACGGATTCGTGCATTTTGGACTCAATTGCAGGATGTTTGGTTGGCACTTTATGGCAGCAGTGTGCCAACAGCAGCTGCCATTAATGGCCATTCCCCTGCCGGCGGCTGTTTGTTGGCTGCCAGCTGTGAATATCGCGTCATGCTGCCAAAATTCACAATTGGCTTGAACGAAACTCAACTTGGAATTGTGGCACCCCAATGGTTTATGTCCACTTACCTCAGTATCCTGCCACGACGTGAGGCTGAACGTTCCCTAAACCAGGGACGAATGTTCACCACAGAGGAAGCACTGCGTGTCGGCCTGGTCGATGAGATTGCCAGCAGCAAGGAGGAGGCCTTGGCCAAGTGTGCTGATTTTATTGCTACATTCGCCAAAGTCAATCCGTTGGCGCGCTCCTTGACCAAGCAACAGTTTAGATCGGCTGACTTGCAACAGTTGGAAAATGAACGTGTCCAAGATTTGAA 4 2 5' arm Drosophila_grimshawi mirnest 100 100 -40.9 ...((.(((((((.(((..(((((((.....(((...(((.(((((..((((((.((((...)))).)))))).))))).)))..))))))))))..))).))))))).))....... (-40.9)