mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACTCACGCACACACACACAT GTGTATGTGTGTGTGCTTGTTGT TCCCCCATTTCAACTCACGCACACACACACATGAGTACATTTATGAGAGTGTGCATATGTGTATGTGTGTGTGCTTGTTGTGCTTCCCG CGCACAGCAGATTACAGGAACACTCATCATTAGACGAAAAATGAGCATTTTATTACATCCCATACACGCTCATCAGACATCATAAAAAACGACACATTTTTGTATTCAGAGTCGCTGGACACACTTTGTGGTTGGTTCGAACGGCTGCGCTGGCTCGACTTGGCTGCGGTTCCACTGCAAGTGCTTCCCGCCTGCACTATTCTGTTTGTCACTGCCAACTGTCGTTGTGTGCATACTCGTGGCCTGTGTATGTGGTTGTGTGCGCGTGTGTGTTCGCTGGTGTCTCAGACAATTGACACAGCAGTCGCACTCATTTATAAACGCCTCGAAAAACACTTTTGAGTAATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCGGCGGTGTGAAGTGCTAGAGAGTGGGCAAGTGCGGGACGAAAGGTGATCACTTTTATTAAGGTAGCAATAAAAAATACACACAAACTGTGAGGACACAATGGACACAACGCGCGCTGTTCAGACGCGCAAGGTGCAGAAGAGAAGACTCTGCGAAAGGGCAAAATGAGCATAAGAGCTCCCCCATTTCAACTCACGCACACACACACATGAGTACATTTATGAGAGTGTGCATATGTGTATGTGTGTGTGCTTGTTGTGCTTCCCGAGCCTGCTGGAAGAGAAAATTGTTTGGTTGCTCCGTACAAGTGGGTGTTATTGT 2 2 5' arm Ceratitis_capitata mirnest 100 100 -34.4 ..........((((.((((((((((.(((((((.((((((((....)))))))).))))))).))))))))))...))))......... (-34.4)