mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTATGTGTGTATGTACATT TGTTCATATATAACATATATGC GAGGCAGGATTGGGTGCGTAAATGTATGTGTGTATGTACATTCATACAGTGAGACATCAAGGTCTGCGAGCACGTTCCCAATGGAATGAATGAGACAGTGGTTTCAGAGTTGTTCGGATCCCAATGTTCATATATAACATATATGCGTATCTATTGTCTTGATG TATCAAACTCGACTGGGACACGGAGATCAGCAGGAGGGGTTAGGGGGGTTATGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCACACCTAACACCCCCTCACTTTTGACTGTCGGTACAACACAGAGACAGAGACTGTGCGATACAAATATTTTATGCTCTACTACACACTTCATCCAATGTATATTGATATTTTTAAAGCATTTTTATAAATGAACATCCAAAATGTATCGATGCCGTTACTACTAAGTGTCCATCATGAGGAGGCAGGATTGGGTGCGTAAATGTATGTGTGTATGTACATTCATACAGTGAGACATCAAGGTCTGCGAGCACGTTCCCAATGGAATGAATGAGACAGTGGTTTCAGAGTTGTTCGGATCCCAATGTTCATATATAACATATATGCGTATCTATTGTCTTGATGAATTTGGTCAATGCCTGGTATCAAACCTGCGTCCTCCAGAGTCGACCAGAGGGTAACGATGATTGTTCAGGCCTTGGCACACGCCGCATGCCTTCCACTAGAAGCTGGTGTA 1 1 5' arm Hippoglossus_hippoglossus mirnest 100 100 -43.4 (((((((...(((((((((..(((((((((((((((.(((((((.((..(((....)))..)).))((((((((((((....))))))..((((((....))))))....))))))......))))).))))))).)))))))))))))))))))))))).... (-43.4)