mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGGGGGGGGGGGGGCGGGT CCCCCCCCCCTCCCCCCGCC TTTTATATTAAGAAACACCCTCCCCCCCCCCCTCCCCCCGCCCCCACCCCATATGATTATATTTTTTTTTATATTTTTATTGTGTGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGCGGGTGGGTTTTTCCTCTTTCCCC CCCCCCCCCCCCCCCTTCTTTAATTTTTTTTGGGGGGGGGGGGAGGTGCCACCCCCCCCCCTCCCCTTTCTAAAAACAATGGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTTCCTTTTATTTTAAGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGCGTTATCCTCTCCCTCCCCTCCCTCCCCCAACAGGTGGGGGGCGGGGACGCGCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGACTATAAATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTGTTATTTTGAGCAGCCCCCCACCCACCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCTCTCCCCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTATTTTTATATTAAGAAACACCCTCCCCCCCCCCCTCCCCCCGCCCCCACCCCATATGATTATATTTTTTTTTATATTTTTATTGTGTGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGCGGGTGGGTTTTTCCTCTTTCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCGCTNATTGTCCCTCAAAAGAAACACAAAAA 1 1 3' arm Ambystoma_tigrinum_tigrinum mirnest 100 100 -70.2 ...........((((.((((.((((((((((((((((((((((((((...(((.((.((((........)))).)).)))...))))))))))))))))))))))).))).)))).)))).......... (-70.2)