mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGGCTGAGGCAGGAGGATC CTTGGCTGTGGCTTTGTG TGCCCGTGAGCACTGCCAGTGTCTTGGCTGTGGCTTTGTGATGTGGGGAAACTGGAACCTGACCGCCTGGGATACGTTTCTTAAACTTTAAGATAGCCCTGCATGGTGGGGCATGTCTCTTACCCCAGCAGTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCGCTGGAGTTCAAGGCCAGC ATTCGGAAGGCGTCACTGCTACGGGATGGTAACAGACTGCTTTACAGTTTGTTTCAGATGTAGCAGACACGAAACACTGCCAAAATACCAACCTGAGTAGCTGCCATGAAAAAGGGGTTTAGTGTTAAGAACAAGGAATTCTCCCACAAAAGTAGAACAGAGAGCAGATTCATTATGAGTGGCTTTTGAAAGACACGTGTGAAAGAGACAGAGATGGCTCAGTTCAGTCGCATGCACAGCAGGAGTCCCAGGACCACGAGTGGAGCCGCTGGGGACAGGTGTTCTGCCCGTGAGCACTGCCAGTGTCTTGGCTGTGGCTTTGTGATGTGGGGAAACTGGAACCTGACCGCCTGGGATACGTTTCTTAAACTTTAAGATAGCCCTGCATGGTGGGGCATGTCTCTTACCCCAGCAGTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCGCTGGAGTTCAAGGCCAGCCTGTACCACATAGCAAGAACTTGTTTCAAAACACCAAAAGAATAAAAAAAAAAAAGGGGGGACGAAGAAAACAAGA 4 2 3' arm Cavia_porcellus mirnest Metazoa_SRP 0.00000004 100 -58.8 .(((..(((((....((((((((((.(((.(((((((.((((.(((((.....((.((.((.(((((.(((.......((((((...))))))...))).....)))))..)).)).))...)))))...)))).))))))).)))...)))).)))))).))))).))).... (-58.8)