mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTGTAAACTAATATAAGAG CTTATATTAGTTTACGGAGGG TACACTACTCCCTCTGTAAACTAATATAAGAGTGTTTAGATTACTAAAATAGTGTTCTAAATGCTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACATT AAAAAAAACGACAGCGTTCTTTCAGACAAAAGTCGAACGATATATTCACATAGGTCAGTGTCAGAAGTCAAAAAGAGAGCATGATTTCATGAGAGCTATGTTTGTACACTACTCCCTCTGTAAACTAATATAAGAGTGTTTAGATTACTAAAATAGTGTTCTAAATGCTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTACATTTTAACAGCTACTAGCACCATCAAGGCCAGCCAAGTCAAATTGCCAAGTTCCCGCCGGTCTCTATGCAGGCCAGGGAAGAAACCACATGCCCAGCCTTGTGCCGACACGCGCTCTCATCACGCCGCCTCGCCTCCGATGTTAGATGGATGAAGCTAACACATCCTGGGGCCGACGCCAACTGGCAGCTTCCCGGACCCGCTCTGTACATCTCACCAGGAACCTGAAATCATTCTCCTGTTCTAGCATTCAAGATGTCCGCCTGCCATAAGGCACCT 0 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 3e-35 tae-MIR1121 8e-20 -53.1 .....(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((...))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))).... (-53.1)