mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGATTACAGGCATGCACCA GTACACACCTATAATCCCAGC CTGTCTCAGCCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCCACTTAGTAGCAAACATTTTAATTAATTGAATTTTTAAAAACAACTAACATTAAGAAGACTCAAATGGAACAACTGAAAAGGGTAAGAGTAATGATTATATTCAATTTGTGAGCTAGATACAGACAAGGTGGTACACACCTATAATCCCAGCACTCTGAG TCCGATTTTGAGACAAAAATCTCACTAAGCTGCCTTTATGAGACTCATACAAGTGATCTTTCTGTGTCAGCCACCCATGTGGGATTACAGGTACGCCACACACCCAGCTCTTCATTTTATTAGTAGCTAGAATTTTTGTTTGACAGTGGGTTTGTTGGTTTGTTTGCTAGTTAGTTGGTGGTTTGGAAATTTTGTTTGTGGGGTTTTGACAGGGTTTTACTATGTAGCTTAGGTTTGTCTTCAAATCAAAGGAATCCTGTCTCAGCCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACACCCCACTTAGTAGCAAACATTTTAATTAATTGAATTTTTAAAAACAACTAACATTAAGAAGACTCAAATGGAACAACTGAAAAGGGTAAGAGTAATGATTATATTCAATTTGTGAGCTAGATACAGACAAGGTGGTACACACCTATAATCCCAGCACTCTGAGAGGTGGAGGCAGGAGGATTCCAAATTTGTGCCCCGTTTTGGCAATTAGCAAGAACCTGTCTCAAAATAAAAAATAAAACAGGATTGAGGATGTAACTCAGTTGTGCAGGTCCCAGGTTCAAACTCTAGTACTACCAAAATGAAAACAAAAAACTCTGAACTTTAATTAATGTCAGTATACTGTAATGTTTAGAAAAGTGTATTTTCAACCAATGCTG 4 0 5' arm Cavia_porcellus mirnest Metazoa_SRP 0.00000001 100 -41 ....(((((.(((((((((.(((..((.((((((..((((...(((((......((((.........(((.(((((((............)))))))...))))))).....)))))...))))..(((((.......)))))..((((((.......))))))...)))))).))..))).)))))))))....))))) (-41)