mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCAAGTAATTCAGGTGGTAG GCCACAGTGGAGACGTGACGA GAAGCGCGGGTGGCCACAGTGGAGACGTGACGAGTACGTGGTCAAGTAATTCAGGTGGTAGCCTTGGAGG GTGAACGTCGCTTCTGGCAAGGAATGGGGGCAATGGCGTTCCTTAAGGTTGCCGTGCTCGCACTCGTTCTACATGTGGCATTTGCTCGAGTAGGTGGTGGATGTTCCAGTTGCAACAGAGGGTCGGGTGGATGTCCCGGTTGCTCCAGCGTGTCGGGCGGTCGCTCTTCAAGTGGCTCTGGTGGCTTCGATAGTACATTTGGGGGTGGTGGCTACGGTGCCAGCAGTCGCGGCGGCGGAGGCTTGTTGAACAGCGGCTCTGCTGCAGCCTTGGGGGGTGCCGCCGCTGCCTTTGGCGCCGGTTTGTTGGGCGCTGGCTTGGGTGCTGGCTTAGGCGGTGCCTCTCGCGGTGGCCTTAGCGGTGGCTCTGGCGGCGGCTATGGCGGTAGACTTGGCGGAGGACTTGGCAGTGGTCTTGGCGGTGGACTTGGAAGTGTCTCAGGAGGCGGCTCAGTTTTGTCGGGCCATGGCTCCACTGGCTTGAGTGGAAGCGCGGGTGGCCACAGTGGAGACGTGACGAGTACGTGGTCAAGTAATTCAGGTGGTAGCCTTGGAGGTGGTTCTGGCGGAGGCCTTGGCGCTGGTCTTGGTGGCGGAAGCGTTGGCGCATCAGGAGGCAGTGGAATAGGTCGGTGGAGGTGCTTCCCTACGCG 4 2 3' arm Rhipicephalus_appendiculatus mirnest 100 100 -21.2 .......((((.(((((..((((.((.((((.........)))).))..)))).))))).))))...... (-21.2)