mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGTGTGTGTATGTGTGTG CATAAATTAAATATCAAAACA CTTCACATAAATTAAATATCAAAACATTTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTTTGGTTTTG CTTCACATAAATTAAATATCAAAACATTTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTTTGGTTTTGTTATTTTCTTTTCGCCCCATCGAAGCAACATACGAGACCACGGTTGCTATGTTAGAGTAGTAGCGCGTTACTAAAGATGCTGCAGTATGCGTGTGTATGCGTATGAGAGGTGTTAATGAGAAAGAATAAAAGCTTCCGACGGAAAATCGATCTCTTGCTCACTTTCACAAAAATCTTTCTAGCAACAAAGCTACTTTCCTTTAAACAACAAAATGGCACCCAAAAGAAAGGATCTTCGCTTTTTCTTTGTGTATCCCTTTTTTAAATGTTTTATGTTAAGCTGTTTGTATTTTGGACGATGATTTGTAAGGTCGGTGTGTTGTTACTACGAAGGATACCGGTAATAGCTATTATACTTCTTTTCCCC 3 2 3' arm Anopheles_stephensi mirnest 100 100 -8.6 ((.((((((...((.(((((((((...))))).)))).))..))))))...))..... (-8.6)