mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCGTAAACTAATATAAGAA TTTATATTAGTTTATATAGTG CAGCCTGAAACCTGTTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAACGTTTGGATCACTATTTTAATGATCTAAATGCTTTTATATTAGTTTATATAGTGAGTACATGTAACTATCCG CCAATTATCTGACGAACAATTTTCAGATACAACCGCGTCAGCTGCCCGGAATCGCAGAAAACAGGCGGACACATTCCACAACAACAACCCAGATTGATCGAGTATTCTGAGTTCACTTCTTTCACACCAGTGTCGCCCGAAGCAGCCTGAAACCTGTTACTCCCTCCGTAAACTAATATAAGAACGTTTGGATCACTATTTTAATGATCTAAATGCTTTTATATTAGTTTATATAGTGAGTACATGTAACTATCCGGCTCTGGCTTGGCCGATCTAGCAATGGCTTCAACGGCGAGGCAGAATCCTTTTTTGCAACTAAGGGCACTTGGGGCGTCCCTCCTTGGTCTTCCAGTTGTTGTAGCAGGGGCACTCGTACTTGTGGCCGTAGAAGCCCGACGGCACGCACAGGCAGGTGTTGCAGCACTTGTTGCAGAAGAAGAGGCACGGCTTCCTGTACTTGGTGTCGCTGCACCGGTACTCGCACACCGGCTTGCACT 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 2e-24 tae-MIR1121 0.000000006 -33.1 .........((.(((.((((.((..((((((((((((((((.(((((((((((.((...)).))))))))))).))))))))))))))))..)).))))))).))......... (-33.1)