mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACACGCACACACACACAC GTGTGTGTGTGAATGTGCACA TTTTTAATGCACACGCACACACACACACACTCATATACCTACCCCGGAGTACACAGCAACCACCTTTTGATCCATATCGAGTAATTCGTAGTAAGAAACGAAAAAGCGAAACCAAACAGCAAAATCCTAATAGTGCGCACATTGGACTGATATGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGCACAAACA GGCAGCCATTTTAAGAACAATCAGCAGAGCCTCCTTTTTAATGCACACGCACACACACACACACTCATATACCTACCCCGGAGTACACAGCAACCACCTTTTGATCCATATCGAGTAATTCGTAGTAAGAAACGAAAAAGCGAAACCAAACAGCAAAATCCTAATAGTGCGCACATTGGACTGATATGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGCACAAACAACAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAGAATCGTTGGAGCGTGATAATCCAAAGAAAATGCCATTTCCCCTGCCCCCACTTTGAGCAAAGTTTTGTAATTTTTGCAGGGGTGGGGGGGGGTGGGGGGAAAAGGAAGGAGGAACTCTTTTGCCCTGTCGTGCGCGTGAAATCTTTGTGAAAAGTGGTGCAAAGATTTGTAGAGCAGTCGAGCCAGCATT 2 0 5' arm Anopheles_stephensi mirnest 100 100 -42.8 .......((((((..(((((((((((((((..((((.......((((.((.....(((......(((((.......(((.....(((((........)))))....)))..........))))).........)))..)).))))....)))))))))))))))))))..))))))...... (-42.8)