mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATTTTGTTTTTTTGTATTA ATACATTGAAATGTTATTACG AAGCCATATTTAATACATTGAAATGTTATTACGATATGGATAAAAGAGCATTCTTTTTACCGTAGAAAAATTATTGGATGTAAGAAAATATGTAATTTTGTTTTTTTGTATTAAGTTTTTTA GAAAAGCTTTATAGTTTTTGGATTTTTAGTTTGTGGGGCAATGGCTTTCACAGAAGAACAACAACAGCTGATGGATTCTTTACATGCCGAGTGTGTATCTCAAACTGGAGTTGGTGAAGATGCCATTGGCAAAGCAAAAGGTGGAGATTTTGTTGACGATCCCAAATTAAAATGTTACATGAAATGTGTTTTTAATGAAATTGGTGTGATAACTGACGATGAAAAAATTGACATAGAAGGTGCTCTAGCTATTTTACCCGATGAGTTGAAAGATATTGCTACCCCAGTAATCACAAAGTGTGGTACTCAAGCTGGTGCAGATGTATGCGAAGCCATATTTAATACATTGAAATGTTATTACGATATGGATAAAAGAGCATTCTTTTTACCGTAGAAAAATTATTGGATGTAAGAAAATATGTAATTTTGTTTTTTTGTATTAAGTTTTTTAAAAAGTGGCATCATTAAAAATGTATTCGTAATGTTGACTTNNNTAAACGTTTTTTTATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGG 4 0 3' arm Diabrotica_virgifera_virgifera mirnest 100 100 -21.1 .......((((((((((..((((((..((((((.(((((..((((((....))))))..))))).....(((.((........)).))).))))))..))))))..))))))))))...... (-21.1)