mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCTCAAAATA TTTTGGGACGGAGGGAGTACA TTGCTATTTTCTACTCCCTCCGTCTCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACAGTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACATGCAAGTC AGCCTGATGCCTATTTTTCTGAGCGCGATGGAATTCACTGCTTGCTATTTTCTACTCCCTCCGTCTCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAGCTCTAGTACAAAGTTGTACTAAGCTTGAGACAGTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACATGCAAGTCTGAGTAGGGTCTTGAGTTTTT 0 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 6e-37 far-MIR1122 0.00000009 -57.2 ((((.......((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((....))))))))))).((.....)).))))))).))))))))))))))))))))))...))))... (-57.2)