mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGCTGCTGCTGTTGCTGTT CTTTACAGCAGCAGCATTTG GTTAACGGAGCCTGTGAATGTTGTTGCGGATGATGCTGCTGCTGTTGCTGTTGTATGATATGGACATGCGGCTGAACGTAATTAACTTGGTTATAGCCTTGGATCCCGGGCGCAATGTATAGACCGCCAACCGTAGCTGCTGTCCCAAGTCTTAACTTTACAGCAGCAGCATTTGCTGCAGCAGCAATTACAGCTGCATTCTC CAGCCAGAAACAACAAACGAGAGACACAGAGGAAATAAGCGGGGGCTCTCCCCCCCCCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTCAAAAATATTTTTAAAATTTCAAGGACAGTTAAAGTATTAACAAAACATGGGTTTAGGATAATTCAAAATATATTTCTTAAATAAGGCTGATAAATAAATAGAAAGATAGATATATGCCCACGGGTCCACAATATATGCCCAAGCCCCGGTATTGGCTTACGTAAATCGCAAAGTAAGTAATAAATTCCTTAATACGGGCAAATTATGAAAGCTTACCAAATTTTGGAATTGAAACGCGCTGGGCATCAGGATCAGTGGGTCGGTATACAAGTCCATGAATATATATATATATATATACATACATACATACATACATACATATACATATACATATATTTTATTTATTTATAGAGTAAAAAAAAGGCTTAATTCTAAGTTAAAAATCTTATGCCTACCAATACAAAAACTAAATAATTTTAACTGAAAAAAACCAATAGTGCAACAAAAAGGTTATGATGAAACGACGTTGACGTTTTTACAAAACAGAAGGAATACTATAGGAAAATAGAGAAATATGAACAGCTTAAACTTCTGTCGATCTGTTTTCCTCGGAACGTGAAAGTTTTCGTTCACGCCCAGGAATACGACCAGTTAACGGAGCCTGTGAATGTTGTTGCGGATGATGCTGCTGCTGTTGCTGTTGTATGATATGGACATGCGGCTGAACGTAATTAACTTGGTTATAGCCTTGGATCCCGGGCGCAATGTATAGACCGCCAACCGTAGCTGCTGTCCCAAGTCTTAACTTTACAGCAGCAGCATTTGCTGCAGCAGCAATTACAGCTGCATTCTCCCGAGATGCATTACTAGTCGTAGTCGATTGAAAAGATATTGACATTCCGCTATCTAGAGAACCTACACTTCCACGTCTTTGTGGTTTATCACCGCCGAATTGTTCATGTATATCCAACAAACTATTGCTCAAGCACTACGTTTCAGTTGTGATTTGATCATCGTAGTTGTGCAGTCCGTTTGCTGTGGCGTCGAAAAGACTGACAACTTCTACGTCAGCACGCCACTGTCACGTTCGATCCCCGTACAATGACCTGCCAT 3 1 5' arm Haematobia_irritans_irritans mirnest mir-598 0.0007 100 -77.8 ........(((.(((((.(((((((((((..((((((((((((((....((((...(((.((((((.(((((((............(((..(((.(((((((...))))).)).)))..)))...........)))))))))).))).))).))))...))))))))))))))..))))))))))).))))))))........ (-77.8)