mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACGCACACACACACACACAC GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG CAGATATTACACACACACGCACACACACACACACACACACTGATACTGATGAGAGACGTGAATGGAAAGCCTGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCAGG GAATTCGAATTCGAATTCCCTACCATCATACCAAGAGCAATATTGTAGATTTATTCAGATATTACACACACACGCACACACACACACACACACACTGATACTGATGAGAGACGTGAATGGAAAGCCTGCCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCAGGTGAAACTATTGTCATGAGCAGAATAATCTAGAGTGAGAGTTAATGTCTTGGTAAGGGAAACAAAGATTAAAATTCCATACACTGACACTCCTGGTATGAACGTGAGAGTATGTTGTTTGGTACCTGACTGACTGATATGTGTGGTAGTGATGTAGTAGTAGATGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGCTAACTTATTGAGGTCAGCTATTTATTGAGAGGAACAGTTACTTAACCATGAATAAAGAAAACACGTTGAAACTGACAGAGAGGAATATTAAGTTAATCAAAAGGTATCTGTACATATCTATATACATTCCATATTTCTAAACCATGCCCTCCTCTTTATACCTTTTATTTGTTTTCTTCCTTTATTTATACACCAATCATCAGGGTCTTTCACACCTGCTGCTATACAGAGGGCAG 0 0 5' arm Eriocheir_sinensis mirnest 100 100 -55.1 ..(((..(((((((((((((((((((((((((((((((.((.((....)).)).((.(((...((....))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))... (-55.1)