mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG GGGTCGTCCTGAGACCACATG ATCTAATAGATGTGGAGGTAGGGGTGTTCTACAGGGTCGTCCTGAGACCACATGAGGTTCAAGGGTTTCGGATTATAACAGGCAATCATATATTCTCTTGTTCTTTTTTACTTGTGACTGTCATCAGTTGGTACATTCCTAGTTCGGTTTTAGCCATTAATCTCGATTATGTATATATTTTATGATTGAAATTAATGGCTAAAACTATTGAAACATCAGTATTTCTAAAATACTTGAAACACTATATTTTTTATTTAAACAAACTGGTTTGTAGTTGTACCAAACAATGACGGTAACGGAAAAAAAAACATCAGAGTATATGACTGTGGTTCGATCTGAGAGCTTACATTGCTCATATCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCGGGACTTTCTCTACTAAATTACGGGATTG AATCATCACATTGGTATAACATGATTGAATGAATATTCAATTGTCCAATTTCATCAAACACAAGTATCTAATAGATGTGGAGGTAGGGGTGTTCTACAGGGTCGTCCTGAGACCACATGAGGTTCAAGGGTTTCGGATTATAACAGGCAATCATATATTCTCTTGTTCTTTTTTACTTGTGACTGTCATCAGTTGGTACATTCCTAGTTCGGTTTTAGCCATTAATCTCGATTATGTATATATTTTATGATTGAAATTAATGGCTAAAACTATTGAAACATCAGTATTTCTAAAATACTTGAAACACTATATTTTTTATTTAAACAAACTGGTTTGTAGTTGTACCAAACAATGACGGTAACGGAAAAAAAAACATCAGAGTATATGACTGTGGTTCGATCTGAGAGCTTACATTGCTCATATCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCGGGACTTTCTCTACTAAATTACGGGATTGTTTTCAAAGTGTATTTGAATTGTGGATGCAGTTCCCACAAATGAAATTGAAGGTAAAAT 3 0 3' arm Arachis_duranensis mirnest MIR398 0.000002 vvi-MIR398c 0.00000009 -134 .((((.......))))((((((((.(((((.(((((.((.(((((((.((((((((((...(((.(((((((((..(((..(((.(((((((((((..((((.((((((...(((.((((((((...((((((((...(((....((((((((((((((((.(((((((((.........))))))))).))))))))))))))))..(((((.((.(((.((((..........)))).)))..)).)))))..(((((......)))))))).))))))))...)))))))).))).)))))).))))..))))))))))).))).))).))))))))).))).....)))....))))))).))))))).)).))))).)))))..)))))))).((((....)))). (-134)