mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACCCTGAGGCACTCATACC TATGAGTGTCTCAGGGTCAAA TCCCTTCTGGCCAACTGAGTTTGACCCTGAGGCACTCATACCGCTACCTAGTTTGGAATGTTTACCGTATGAATGGCTCAGTTAGCGGTATGAGTGTCTCAGGGTCAAATTTTGATTGCCGGAAAAA CACGCGTCCGGTCTCTTCTCTTCTTCTGGCCACTGGAGTTTGTACCTCCTCTCCACCTTCCAACTACAACCACCTCTCCACCTTCCAACTACAACTCCTAAGGTCTCTTCTCTTCTTCTGGCCACCGGAGTTTGAACCTCCTCTCCACCTTCCAACCACAACTCCTACGGTCTCTTCTGTTCTTCTGGCCACCAGAGTTTGAACCTCCTCTCCACCTTCCGACCAGAATTCCCTTCTGGCCAACTGAGTTTGACCCTGAGGCACTCATACCGCTACCTAGTTTGGAATGTTTACCGTATGAATGGCTCAGTTAGCGGTATGAGTGTCTCAGGGTCAAATTTTGATTGCCGGAAAAACAACAACGGCAACAAAGATAAAAATATGTTTTTATAGAAAACCTTCTATCTCGGAGGGACCAGAACAAGCGATGAAAAGATAGACAAAAATGAACAG 0 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest 100 100 -62.4 ....(((((((.....((((((((((((((((((((((((((((((......((((..((((((.....))))))..)))).)))))))))))))))))))))))))))))).....)))))))... (-62.4)