mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGTATCTGAGTGTTTCTG GAATTCATCAGTGCTCCAGG TTGCACTCGCCTGGAGTATCTGAGTGTTTCTGACAAAGTGAACCATCCTTGCATTTTGGATAGCTTTTTGACCCATTTACCTCCAAGTCTGAAAGGCTTGAAATTTGACCTCCGTGATTTTCGTGATCTGATGGACTTAAATATGAGAAATGTCATGAGAGATGTAATGACAGAATTCATCAGTGCTCCAGGATCGAGAG GCTCGTCATTGAATCATAATCCAAACTTGGAAGAATTGGAACTAAATTTATTCAATGGTCCAAATGTTGTTACCATTTTGGAACAAATACTGCCATCAATGATCCGCCTCAAGAAATTGACGATTGTTATTCAAGGTATCCAAGATGTCACCGCCCCAAGACGCCTTAACCTTCAGCAACTACAACTTTGCACTCGCCTGGAGTATCTGAGTGTTTCTGACAAAGTGAACCATCCTTGCATTTTGGATAGCTTTTTGACCCATTTACCTCCAAGTCTGAAAGGCTTGAAATTTGACCTCCGTGATTTTCGTGATCTGATGGACTTAAATATGAGAAATGTCATGAGAGATGTAATGACAGAATTCATCAGTGCTCCAGGATCGAGAGTTTTGACTGTCTTGGCAATTAAACATGGGACTTTGATCGGTGATGCTGANATGCAAATTATTATAAGGAATATGTCCGGACTTCGTGAACTTTGTGTGAATGATTCACCAATTTTAACGGATACGGGAATCACTGGTTTGCCGA 4 1 5' arm Onychiurus_arcticus mirnest 100 100 -45.9 .....(((.(((((((((.((((....(((((.(((((((...........))))))).(((.(((..((((..((((..((((((((((...)))))))..((((((..(((((((((.....))))..))))).))))))..))))))))))).)))...))).....)))))....)))))))))))))...))).. (-45.9)