mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGATGTCAGATGGTGCTGTCG ACAGCGNCGANGACGACGGC AGCAGCAATCGAACGAGCTCACGATGTCAGATGGTGCTGTCGTGACCATCACAGCTCCAGTGAACATGAATGTAGACAGCCTGCAGTCCTTGTCCTCAGATGGTGCCACCCCTGGCTGTGCAGCAGGTGATGATGGCAGGGCAGANCGAGGACGAGTCCGTGGACAGCGNCGANGACGACGGCGGAAACCTCTCGACAGCA GGGCAAGTGCCATTGCAGGCACACTCAGTCCTCAAGGGATCGTGGTGCCAGCATCAGCATTGCAGCAGGGAAATGTAACTATGGCAACAGTAGCAGGGGGGACAGTGTATCAGCCAGTCACTGTGGTCACTCCACAAGGACAAGTGGTGACACAGGCACTGTCACCTGGGACTATTCGGATCCAGAACTCTCAGCTCCAGTTGCAATTAAACCAAGATCTAGGCATCTTGCATCAAGATGATGGCTCATCAAAAAATAAGAGAGGAGTTCTTCCCAAGCACGCTACAAATGTGATGAGATCTTGGCTTTTTCAGCACATAGGGCATCCATATCCAACAGAGGATGAGAAGAAGCAGATTGCAGCACAAACAAATCTGACACTACTCCAAGTTAACAATTGGTTTATCAATGCTAGAAGGCGAATTCTTCAGCCAATGCTGGATTCCAGTTGTTCTGAAACTCCAAAAACAAAGAAGAAAACAGCCCAGAACAGACCAGTGCAGAGGTTCTGGCCTGACTCCATTGCCTCAGGAGTTGCTCAGCAGCAATCGAACGAGCTCACGATGTCAGATGGTGCTGTCGTGACCATCACAGCTCCAGTGAACATGAATGTAGACAGCCTGCAGTCCTTGTCCTCAGATGGTGCCACCCCTGGCTGTGCAGCAGGTGATGATGGCAGGGCAGANCGAGGACGAGTCCGTGGACAGCGNCGANGACGACGGCGGAAACCTCTCGACAGCAATATCAGTGGGCTGGTCCTGGATAACAGCGACTCTCTGCAGTAAGGAAGGCAAAAAGCCTGGAAAAAAAACCCTTAGGAACAAGAAGGGACTGACTGACTGACTTTTTATATTTGGCCCNGCAAACNTTTTACCCAAGTTTTNTTTCNAAAAGNTTTTTNNGNAAAANTNANAAGGG 5 1 5' arm Lonchura_striata_domestica mirnest 100 100 -53.5 ....((..((((..(((.((.((.((((...((.(((((((.((.((((((..((.(((.((((((.((.(((((.....))))).))..)))..)))..))).))((((....(((....))).)))).))))))))..((.((.((....))..)).)).))))))).))..)))).))...))...)))))))..)). (-53.5)